根據臺鐵列車長描述，當時臺鐵區間車正要行經臺一線275公里處水上路段平交道前，突然一輛黑色轎車飛越柵欄，直接撞進鐵軌，整輛車剛好卡在鐵軌上，車頭與正要行駛而來的臺鐵區間車正面相對。

　　但當時區間車已經距離轎車幾十米，駕駛員根本無法反應，即使立刻煞車也只能瞬間撞上轎車，造成40歲蘇姓轎車司機死亡。由于撞擊力道巨大，轎車車體變形扭曲，被輾成一團廢鐵。

　　根據調查，臺南蘇姓男子7日晚11點多獨自駕車出門往嘉義市，沿臺一線北上經約257公里處，疑似為躲避1輛回轉轎車撞上路邊樹木后，飛越約1米高鐵道護欄，掉在鐵路軌道上，與迎面而來臺鐵南下區間車碰撞。

　　事發時，列車上約有30名乘客，臺鐵調派區間車接駁乘客到嘉義車站并展開救援。