神舟十三號任務與神舟十二號任務有六大不同：

　　一是載人飛船將采用自主快速交會對接的方式，首次徑向停靠空間站；

　　二是屆時中國空間站將實現核心艙、2 艘貨運飛船、1 艘載人飛船共 4 個飛行器組合運行；

　　三是航天員將首次在軌駐留 6 個月，這也是空間站運營期間航天員乘組常態化駐留周期；

　　四是中國女航天員將首次進駐中國空間站，航天員王亞平也將會成為中國首位實施出艙活動的女航天員，而神舟十三乘組也將包括中國首次出艙的男女航天員；

　　五是在神舟十二號任務的基礎上，進一步開展更多的空間科學實驗與技術試驗，產出高水平科學成果；

　　六是實施任務的飛船、火箭均在發射場直接由應急待命的備份狀態轉為發射狀態。這些不同，也是我們將面臨的挑戰。

　　中國空間站在軌建設分為關鍵技術驗證和建造兩個階段實施，神舟十三號任務是空間站關鍵技術驗證階段的決勝之戰、收官之戰，也是空間站在軌建設過程中承前啟后的關鍵之戰。通過神舟十三號任務，將更加全面地考核工程各系統執行空間站任務的功能性能 , 以及系統間的匹配性與協調性。